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一、培養細胞(culture cell)樣品處理方法:
培養動物組織細胞由于沒有細胞壁,因此可以將細胞收集下來,直接加入裂解緩沖液(Lysis buffer)抽提總蛋白。裂解緩沖液有多種配方,本實驗室主要采用如下成份:
1. 7M Urea,2M Thiourea,4%(w/v)CHAPS,40mM Tris-Base,40mM DTT,2% Pharmalyte pH 3-10.
其他常用的裂解緩沖液如下:
2. 9.5M urea, 2%(w/v) CHAPS, 0.8%(w/v) Phamarlyte pH3-10,1%(w/v) DTT and 5mM Pefabloc proteinase inhibitor;
3. 加入 0.3-1% SDS 在 95 C 煮樣品 5mins,冷卻后加入至少 5倍體積的(A)或(B)裂解液。
總蛋白抽提程序:
1. 培養細胞的收集;
2. 用磷酸緩沖液(PBS)洗細胞 3 次(室溫,1000g,各 2min);
3. 將細胞分裝到 1.5ml Eppendof管中,吸干殘留的 PBS;
5. 4 C,40,000g,離心 1h;
6. 吸取上清并用 Brandford 法定量蛋白,然后分裝至 Eppendof 管里保存在-78℃備用。
二、組織樣品處理方法:
對大多數從動物或植物組織里提取總蛋白質而言,同樣沒有一種通用的程序。但遵循的原則基本相同。下面列出一種對植物樹葉總蛋白的方法。
三氯醋酸-丙酮沉淀法(TCA/acetone precipitation)提取植物樹葉總蛋白程序:
1. 在液氮中研碎葉片;
2. 懸浮于含 10%三氯醋酸(TCA)和 0.07%β-巰基乙醇(可用 DTT替代)的丙酮溶液在-20℃ 的冰??;
3. 讓蛋白質沉淀過夜然后離心(4 C,40,000g, 1h),棄上清;
4. 重懸沉淀浮于含 0.07%β-巰基乙醇的冰預冷丙酮溶液里;
5. 離心(4 C,40,000g, 1h)后真空干燥沉淀;
6. 用(A)或(B)裂解液溶解沉淀,離心(4 C,40,000g, 1h)。
7. Brandford 法定量蛋白,然后分裝至 Eppendof 管里保存在-78℃備用。
超速離心法:
1. 取材;
2. 用研缽在液氮冷凍條件下將樣品研成粉末,每1g樣品加入0.5ml裂解液,使用組織勻漿器勻漿30 s;
3. 組織懸液15℃,10 000× g離心10 min;
4. 上清液4℃,150 000× g超速離心45 min;
5. 小心避開上層漂浮的脂質層,吸取離心上清6℃ 40,000g再次離心50 min;
6. 取離心上清。Bradford法定量,分裝后置-75℃保存。